Nucleocytoviricota

Nucleocytoviricota
Один из представителей типа — гигантский вирус тупанвирус
Научная классификация
Группа: Вирусы[1] Реалм: Varidnaviria Царство: Bamfordvirae Тип: Nucleocytoviricota
Международное научное название
Nucleocytoviricota
Группа по Балтимору
I: дцДНК-вирусы
Систематика в Викивидах Изображения на Викискладе NCBI   2732007 EOL   58766242

Nucleocytoviricota (лат.) — тип вирусов эукариот, относимый к царству Bamfordvirae^[англ.] и включающий классы Megaviricetes^[англ.] и Pokkesviricetes^{[англ.][2]}. Также представители типа известны как крупные ядерно-цитоплазматические ДНК-содержащие вирусы (англ. nucleocytoplasmic large DNA viruses; NCLDV) или гигантские вирусы, поскольку отличаются очень большими геномами (от 300 тысяч пар оснований (п. о.) до 2,5 миллионов п. о.) и крупными вирионами, достигающими от 200 нм до 1000 нм в диаметре, и, таким образом, сравнимы по этим параметрам с бактериями.

В группу входят следующие семейства^{[источник не указан 2844 дня]}:

1. Asfarviridae
2. Ascoviridae
3. Iridoviridae
4. Marseilleviridae
5. Megaviridae
6. Mimiviridae
7. Pandoraviridae
8. Phycodnaviridae
9. Pithoviridae
10. Poxviridae

К этой группе относят также род Dinodnavirus.

Вирусы данной группы имеют общие и уникальные особенности геномной ДНК и структуры вириона. Однако не известно, имеют ли эти семейства общего предка либо эти общие черты возникли независимо друг от друга в результате рекрутирования генов хозяина в процессе репликации вирусов. Гипотеза общего предка считается противоречивой^[3].

В настоящее время обнаружено 47 основных генов NCLDV. Они включают четыре ключевых белка репликации и репарации ДНК: ДНК-полимеразу семейства B, топоизомеразу II A, эндонуклеазу FLAP (5-липоксигеназа-активирующий белок) и фактор процессинга proliferating cell nuclear antigen. Кроме этого, сюда относятся ДНК-зависимая РНК-полимераза II и фактор транскрипции II B.

Возможно, эти вирусы возникли до разделения эукариот на коронные группы (группы организмов, состоящих из последнего общего предка группы и всех живущих потомков). Геном предшественников был сложный и состоял по крайней мере из 41 гена, включая гены репликации, до 4 субъединиц РНК-полимеразы, по крайней мере 3 фактора транскрипции, ферменты кэпа и полиаденилирования, аппарат упаковки вирусной ДНК и структурные компоненты икосаэдрового капсида и вирусной мембраны.

• Вирусный эукариогенез
• Гигантские вирусы

• Koonin EV, Yutin N.: Origin and evolution of eukaryotic large nucleo-cytoplasmic DNA viruses. Intervirology. 2010;53(5):284-92. PMID 20551680
• Yutin N, Koonin EV.: Hidden evolutionary complexity of Nucleo-Cytoplasmic Large DNA viruses of eukaryotes. Virol J. 2012 Aug 14;9:161. PMID 22891861
• Yutin N, Colson P, Raoult D, Koonin EV.: Mimiviridae: clusters of orthologous genes, reconstruction of gene repertoire evolution and proposed expansion of the giant virus family. Virol J. 2013 Apr 4;10:106. PMID 23557328
• Yutin N, Wolf YI, Raoult D, Koonin EV.: Eukaryotic large nucleo-cytoplasmic DNA viruses: clusters of orthologous genes and reconstruction of viral genome evolution. Virol J. 2009 Dec 17;6:223. PMID 20017929
• Lakshminarayan M. Iyer, L. Aravind, and Eugene V. Koonin: Common Origin of Four Diverse Families of Large Eukaryotic DNA Viruses. J Virol. 2001 December; 75(23): 11720–11734. PMID 11689653