RpoB

Ген rpoB кодирует β-субъединицы РНК-полимеразы. Это сайт мутаций, которые придают устойчивость к рифамициновых антибактериальным агентам, таким как рифампицин^[1]. Мутации в гене rроВ, которые придают устойчивость к рифампицину. Сущность механизма этой мутации заключается том, что происходит замена аминокислотных остатков рифамицинового сайта в РНК-полимеразе, тем самым снижается эффективность связывания рифамицинов с этим ферментом^[2]^[3].

Зонды нуклеиновой кислоты могут обнаружить мутации в гена rроВ , которые придают устойчивость к рифампицину. Для микобактерий туберкулеза, рифамициноустойчивые мутации наиболее часто встречаются с привлечением кодонов 516, 526 и 531^[4]^[5]. Для золотистого стафилококка, рифамициновоустойчивые мутации чаще всего встречается с привлечением кодона 526^[6].

Примечания

↑ Floss, H.G.; Yu, T. Rifamycin-Mode of Action, Resistance, and Biosynthesis (англ.) // Chem. Rev.^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 105, no. 2. — P. 621—632. — doi:10.1021/cr030112j. — PMID 15700959.
↑ Campbell, E.A., Korzheva, N., Mustaev, A., Murakami, K., Nair, S., Goldfarb, A., Darst, S.A. Structural mechanism for rifampicin inhibition of bacterial RNA polymerase (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2001. — Vol. 104, no. 6. — P. 901—912. — doi:10.1016/S0092-8674(01)00286-0. — PMID 11290327.
↑ Feklistov, A., Mekler, V., Jiang, Q., Westblade, L.F., Irschik, H., Jansen, R., Mustaev, A., Darst, S.A., Ebright, R.H. Rifamycins do not function by allosteric modulation of binding of Mg2+ to the RNA polymerase active center (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2008. — Vol. 105, no. 39. — P. 14820—14825. — doi:10.1073/pnas.0802822105. — PMID 18787125. — PMC 2567451.
↑ Mokrousov, I.; Otten, T.; Vyshnevskiy, B.; Narvskaya, O. Allele-Specific rpoB PCR Assays for Detection of Rifampin-Resistant Mycobacterium tuberculosis in Sputum Smears (англ.) // Antimicrob Agents Chemother^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 47, no. 7. — P. 2231—2235. — doi:10.1128/AAC.47.7.2231-2235.2003. — PMID 12821473. — PMC 161874.
↑ Telenti A., Imboden P., Marchesi F., et al. Detection of rifampicin-resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis (англ.) // The Lancet : journal. — Elsevier, 1993. — Vol. 341, no. 8846. — P. 647—650. — doi:10.1016/0140-6736(93)90417-F. — PMID 8095569.
↑ Wichelhaus T. A., Schäfer V., Brade V., Böddinghaus B. Molecular characterization of rpoB mutations conferring cross-resistance to rifamycins on methicillin-resistant Staphylococcus aureus (англ.) // Antimicrob Agents Chemother^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 43, no. 11. — P. 2813—2816. — PMID 10543773. — PMC 89569.

[Floss2005-1] Floss, H.G.; Yu, T. Rifamycin-Mode of Action, Resistance, and Biosynthesis (англ.) // Chem. Rev.^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 105, no. 2. — P. 621—632. — doi:10.1021/cr030112j. — PMID 15700959.

[Campbell-2] Campbell, E.A., Korzheva, N., Mustaev, A., Murakami, K., Nair, S., Goldfarb, A., Darst, S.A. Structural mechanism for rifampicin inhibition of bacterial RNA polymerase (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2001. — Vol. 104, no. 6. — P. 901—912. — doi:10.1016/S0092-8674(01)00286-0. — PMID 11290327.

[Feklistov-3] Feklistov, A., Mekler, V., Jiang, Q., Westblade, L.F., Irschik, H., Jansen, R., Mustaev, A., Darst, S.A., Ebright, R.H. Rifamycins do not function by allosteric modulation of binding of Mg2+ to the RNA polymerase active center (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2008. — Vol. 105, no. 39. — P. 14820—14825. — doi:10.1073/pnas.0802822105. — PMID 18787125. — PMC 2567451.

[4] Mokrousov, I.; Otten, T.; Vyshnevskiy, B.; Narvskaya, O. Allele-Specific rpoB PCR Assays for Detection of Rifampin-Resistant Mycobacterium tuberculosis in Sputum Smears (англ.) // Antimicrob Agents Chemother^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 47, no. 7. — P. 2231—2235. — doi:10.1128/AAC.47.7.2231-2235.2003. — PMID 12821473. — PMC 161874.

[5] Telenti A., Imboden P., Marchesi F., et al. Detection of rifampicin-resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis (англ.) // The Lancet : journal. — Elsevier, 1993. — Vol. 341, no. 8846. — P. 647—650. — doi:10.1016/0140-6736(93)90417-F. — PMID 8095569.

[Wichelhaus1999-6] Wichelhaus T. A., Schäfer V., Brade V., Böddinghaus B. Molecular characterization of rpoB mutations conferring cross-resistance to rifamycins on methicillin-resistant Staphylococcus aureus (англ.) // Antimicrob Agents Chemother^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 43, no. 11. — P. 2813—2816. — PMID 10543773. — PMC 89569.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]